行政事业单位会计集中核算全国不少地方推开。会计集中核算是财政预算管理改革的重要组成部分，也是会计管理体系的一次变革。
目前，会计集中核算仍处于初级阶段，运作机制尚不完善，会计集中核算就其本身来讲是变革强化会计监督职能。由于这项变革仍处于初级阶段，有关制度尚不健全，监督力度尚不够到位。初级阶段的会计集中核算还主要忙于帐务处理的完善，在审核单位支出，一看票据是否合法，填写是否规范，内容是否完整，二看有单位领导和经办的签字。会计集中核算使单位经费支出的合法性和帐务处理规范化增强了，但是对不合理违规违纪的变通票据就无法控制。因为核算中心人员不能直接参与单位的财务活动，无法跟踪监督。防止会计集中核算后财务管理空心化、形式化已是当务之急，应建立一套完整的财务管理机制。加强会计集中核算后的财务管理，笔者提出以下五个方面看法：
编制经费使用计划。编制经费使用计划，主要是明确经费支出范围和资金使用方向，建立起对可能发生的问题进行事前防范约束机制。编制经费使用计划，要根据全年经费收支预算和事业发展需要，本着“量入为出，略有结余”的原则，制定全面完整的本月经费支出计划。会计核算中心要严格执行经费使用计划，坚决维护经费使用计划的严肃性和权威性。
加大政府采购力度。推行行政采购制度，有效地控制消费节约经费，是预防和控制治理腐败重要的约束机制。会计核算中心对凡纳入政府采购目录的大宗物品和物资报销发票，必须要附政府采购中心开具的“批准采购通知单”，对没有执行政府采购制度所购买的物资一律不予报销。
实行财务会签制度。实行财务会签制度可有效遏制“一支笔”滥用职权，以权谋私，独断专行的不法行为发生。财务审计“一支笔”的制度已不适应会计集中后加强会计监督的要求，不利于群众监督作用的发挥，实行财务会签制度是完善“一支笔”约束和监督机制的延伸。实行财务会签制度要求经办人、仓储负责人或物资验收人，部门负责人和财会稽核人员签字，最后由在限额内由“一支笔”审批。限额量可视单位业务量大小而定，限额以上资金实行领导人集体会签。