荧光光纤传感器以光纤为传导介质，对荧光信号进行传输，再通过检测器对荧光信号进行检测，它可以实现对样品的定量分析。普通光纤由于受到纤芯尺寸和接收角的限制，在荧光收集方面效果不够理想，检测灵敏度低，而采用光子晶体光纤能够很好地解决这些问题。光子晶体光纤的截面可以根据不同需要进行灵活设计。为了增大对荧光信号的吸收面积，在荧光收集方面可以使用双包层结构的光子晶体光纤，这样增加了荧光的吸收面积和接收角，提高了传感器的灵敏度。利用后向荧光检测样品。半导体激光通过双包层光子晶体光纤纤芯照射到样品上，激发样品分子发射出单光子荧光，然后利用较大的包层区域(200～340微米)来收集样品的所发出的单光子荧光，最后用放置在光源附近的检测装置进行分析。其中探测装置和光源放置在一起是为了降低耦合损耗和噪声的影响。实验中所用光子晶体光纤的损耗约为70 dB／km，传感器在15 m远的距离就能够检测出待测样品。这是一种结构非常简单的非接触式检测方法，可以广泛应用在生物、医药、化学反应和环境监测等方面。