墨控系统一般由三个部分组成，即墨斗控制组件、墨控操作台和墨控软件。其中墨斗控制组件是依据印刷机幅面大小设计的一组控制给墨量的墨刀开度元器件及电路系统，其作用是通过电路系统指导电机控制不同的墨刀开度，使墨斗辊在给墨量厚度上形成变化，从而实现在指定区域给墨系统中墨量的需求变化。
墨控操作台则是一个将数据采集、数据修正、数据备份、信号转换、墨斗控制及质量评价的操作平台，其作用依据不同层次配置可以完成以下不同功能的组合。对墨道信号数据的采集，根据机器设备的类型、环境情况、材料选择等因素对原始采集的数据进行修正，将修正后的信号传递到印刷机上并形成墨刀的开度控制，同时墨控操作台可以借助标准或指定的观测环境对印刷抽样样张与打样稿进行视觉或仪器的质量评价比对形成印刷修正反馈从而实现印刷过程的质量控制。
墨控软件的主体一般可以包括三个部分，其一是一个可以对印刷机墨刀开度进行预置计算的CIP3墨道数据预设软件（一般称之为预墨软件或预墨系统），它的信息获取途径是多样的，即可以直接读取RIP后的图文数据（1-bitTiff文件），根据印版大小及墨键数量分析得出机台控制墨区信息，也可以通过PPF档案中的信息得到墨区信息，然后将该信息记录在介质上、打印到纸张上或者直接转换为印刷机墨斗控制组件信号，用于印刷机的墨键预置，从而确保了较高的数据预制精确度，提高印刷机墨区分配的合理性和准确性。其二是对墨刀开度控制进行操作的控制软件。其作用是通过软件进行墨刀控制的各类操作，其中可以有一般操作台直接控制的墨刀开度操作，也可以有对墨刀系统进行的维护性操作，例如零点设置与校正，远程维护等。其三则是印刷质量品质控制软件，其作用是通过选择的仪器对印刷品进行测量，可以是整版检测也可以是部分检测，可以是色度检测也可以是密度检测还可以是色度加密度检测，可以是品质检测也可以是缺陷检测，不同的检测目的应匹配不同的检测仪器。例如整版检测需要匹配整版扫描仪，而部分检测主要是指测控条的检测，此时可以根据不同的要求选择密度计或色度计。同时印刷质量品质控制软件还应该具有动态墨控的功能，在印刷过程中影响墨道数据变化的因素较多，通过墨控软件中的印刷质量品质控制功能得到相关的信息，结合印刷运行情况对各墨区的墨道数据进行动态控制。
尽管一个完备的墨控系统可以有多个组成部分，但是在实际应用中可以根据不同的用户要求进行配置，例如对于墨控软件，如果印刷机应用厂商未使用流程进行生产，或者未配备PPF生成系统，则可以不需要墨道数据预设软件而只需要墨刀控制软件。
再如墨控操作台，如果印刷机应用厂商对印刷品未进行数据化的质量品质控制要求，在配置过程中则不需要加入质量控制模块。因此，一套完善的墨控系统应该具有积木式的结构，可以根据不同的印刷需求匹配不同的功能，同时还应该可以根据需求的变化进行升级或改造。例如一个未加入品质控制模块的墨控软件在出现印品控制需求后应该可以通过便捷的硬件技术改造与软件功能的开放或升级实现控制功能。